Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBAL3A6NHL2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms