Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms