Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN6Q9Y6Q1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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