Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DYNC1LI1Q9Y6G9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms