Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54BQ9Y620 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD54BQ9Y620 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms