Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYVE1Q9Y5Y7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms