Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAXBP1Q9Y5B6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms