Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4S1Q9Y587 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4S1Q9Y587 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms