Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4BQ9Y4P1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4BQ9Y4P1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms