Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM2Q9Y2K5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM2Q9Y2K5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HDM2Q9Y2K5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HDM2Q9Y2K5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms