Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A8Q9Y2E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A8Q9Y2E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A8Q9Y2E8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A8Q9Y2E8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A8Q9Y2E8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms