Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP24Q9UPU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP24Q9UPU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms