Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROTQ9UKG9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CROTQ9UKG9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CROTQ9UKG9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms