Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBD1Q9UJT1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBD1Q9UJT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms