Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBE1Q9UJT0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBE1Q9UJT0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBE1Q9UJT0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBE1Q9UJT0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBE1Q9UJT0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms