Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL4Q9UJQ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SALL4Q9UJQ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL4Q9UJQ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms