Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR3Q9UJK0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSR3Q9UJK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms