Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATPIF1Q9UII2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms