Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP2Q9UDT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP2Q9UDT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.9 ms