Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNAL1Q9UBT7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNAL1Q9UBT7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNAL1Q9UBT7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms