Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLKQ9UBE8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLKQ9UBE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLKQ9UBE8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms