Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PHRF1Q9P1Y6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHRF1Q9P1Y6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHRF1Q9P1Y6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHRF1Q9P1Y6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms