Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM9Q9P0T7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM9Q9P0T7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms