Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNAU1APQ9NX07 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms