Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAK1IP1Q9NWT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAK1IP1Q9NWT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PAK1IP1Q9NWT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms