Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF358Q9NW07 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF358Q9NW07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF358Q9NW07 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF358Q9NW07 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms