Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLIMQ9NVW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RLIMQ9NVW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLIMQ9NVW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms