Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR3EQ9NVU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3EQ9NVU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3EQ9NVU0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3EQ9NVU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms