Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM39AQ9NV64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM39AQ9NV64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM39AQ9NV64 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms