Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L1Q9NU39 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD4L1Q9NU39 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L1Q9NU39 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms