Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3GQ9NS98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3GQ9NS98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3GQ9NS98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms