Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM167BQ9NRX6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM167BQ9NRX6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM167BQ9NRX6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms