Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN4Q9NQP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms