Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED4Q9NPJ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED4Q9NPJ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED4Q9NPJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms