Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC40A1Q9NP59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC40A1Q9NP59 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms