Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM60AQ9NP50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM60AQ9NP50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.2 ms