Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRPM3Q9HCF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRPM3Q9HCF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRPM3Q9HCF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM3Q9HCF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms