Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBX8Q9HC52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBX8Q9HC52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CBX8Q9HC52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX8Q9HC52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX8Q9HC52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms