Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF2Q9HAK2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF2Q9HAK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF2Q9HAK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms