Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf42Q9H799 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf42Q9H799 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms