Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF3Q9H4W6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF3Q9H4W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF3Q9H4W6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms