Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM12Q9H4Q4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM12Q9H4Q4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM12Q9H4Q4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM12Q9H4Q4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms