Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LHX5Q9H2C1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX5Q9H2C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX5Q9H2C1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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