Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K7

STRADB, STE20-related kinase adapter protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBQ9C0K7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADBQ9C0K7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRADBQ9C0K7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRADBQ9C0K7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRADBQ9C0K7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRADBQ9C0K7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms