Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms