Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTPBP4Q9BZE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTPBP4Q9BZE4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTPBP4Q9BZE4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms