Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
HIRIP3Q9BW71 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HIRIP3Q9BW71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HIRIP3Q9BW71 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HIRIP3Q9BW71 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms