Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KATNB1Q9BVA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KATNB1Q9BVA0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms