Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP8Q9BV40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP8Q9BV40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms