Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf16Q9BUW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms